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Curso en Sistema Operativo Linux para Medicina

Curso Online

Cursos Online Universidad Cardenal Herrera CEU

650 €

Objetivos: Objetivos Generales Š Ser capaz de interpretar con precisión el volumen de información clínica disponible actualmente y asociado a los datos biológicos que se generan tras un análisis bioinformático Objetivos específicos Š Aprender sobre el sistema operativo Linux, el cual es actualmente fundamental en el mundo científico tanto para la interpretación de los datos biológicos procedentes de la secuenciación como lo deberá ser para la minería de textos médicos cuando manejamos datos a gran escala. Los motivos son múltiples pero uno que justifica este módulo, es que el sistema Unix es el más popular del mundo y es ampliamente utilizado especialmente en el mundo científico, además, al ser un sistema de código abierto se corresponde claramente con el enfoque científico, de compartir resultados y métodos para garantizar la reproducibilidad de los resultados Š Proporcionar las bases para acceder a un servidor Linux y cómo encontrar e instalar los paquetes para instalar el software en local

A quién va dirigido: El Curso Universitario en Sistema Operativo Linux para Medicina está orientado a facilitar la actuación del médico dedicado al tratamiento de la patología oncológica en la que es preciso interpretar con precisión el volumen ingente de información clínica disponible actualmente y asociarlo a los datos biológicos que se generan tras un análisis bioinformático

Información adicional

Duración: 2 meses

Temario completo de este curso

Módulo 1. Empleo de unix y linux en bioinformática

1.1. Introducción al sistema operativo Linux

1.1.1. ¿Qué es un sistema operativo?
1.1.2. Los beneficios de usar Linux

1.2. Entorno Linux e Instalación

1.2.1. Distribuciones de Linux?
1.2.2. Instalación de Linux usando una memoria USB
1.2.3. Instalación de Linux utilizando CD-ROM
1.2.4. Instalación de Linux usando una máquina virtual

1.3. La línea de comandos

1.3.1. Introducción
1.3.2. ¿Qué es una línea de comandos?
1.3.3. Trabajar en el terminal
1.3.4. El Shell, Bash

1.4. Navegación básica

1.4.1. Introducción
1.4.2. ¿Cómo conocer la localización actual?
1.4.3. Rutas absolutas y relativas
1.4.4. ¿Cómo movernos en el sistema?

1.5. Manipulación de archivos

1.5.1. Introducción
1.5.2. ¿Cómo construimos un directorio?
1.5.3. ¿Cómo movernos a un directorio?
1.5.4. ¿Cómo crear un archivo vacio?
1.5.5. Copiar un archivo y directorio
1.5.6. Eliminar un archivo y directorio

1.6. Editor de textos vi

1.6.1. Introducción
1.6.2. ¿Cómo grabar y salir?
1.6.3. ¿Cómo navegar por un archivo en el editor de texto vi?
1.6.4. Borrando el contenido
1.6.5. El comando deshacer

1.7. Comodines

1.7.1. Introducción
1.7.2. ¿Qué son los comodines?
1.7.3. Ejemplos con comodines

1.8. Permisos

1.8.1. Introducción
1.8.2. ¿Cómo ver los permisos de un archivo?
1.8.3. ¿Cómo cambiar los permisos?
1.8.4. Configuración de los permisos
1.8.5. Permisos para directorios
1.8.6. El usuario “root”

1.9. Filtros

1.9.1. Introducción
1.9.2. Head
1.9.3. Tail
1.9.4. Sort
1.9.5. nl
1.9.6. wc
1.9.7. cut
1.9.8. sed
1.9.9. uniq
1.9.10. tac
1.9.11. Otros filtros

1.10. Grep y expresiones regulares

1.10.1. Introducció
1.10.2. eGrep
1.10.3. Expresiones regulares
1.10.4. Algunos ejemplos

1.11. Pipelines y redirección

1.11.1. Introducción
1.11.2. Redirección a un archivo
1.11.3. Grabar a un archivo
1.11.4. Redirección desde un archivo
1.11.5. Redirección STDERR
1.11.6. Pipelines

1.12. Manejo de procesos

1.12.1. Introducción
1.12.2. Procesos activos
1.12.3. Cerrar un proceso corrupto
1.12.4. Trabajos de primer plano y de fondo

1.13. Bash

1.13.1. Introducción
1.13.2. Puntos importantes
1.13.3. Porqué el ./ ?
1.13.4. Variables
1.13.5. Las declaraciones

 
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